上消化道出血不僅是因為食管疾病所引起，還可能是因為胃、十二指腸出現異常，而引起的出血的情況。對於食管疾病引發的上消化道出血，可能是因為食管出現炎症而引發的上消化道出血，還有可能是因為劇烈的嘔吐，引起食管下端的黏膜和黏膜下層出現撕裂，引起上消化道出血。如果患者患有反流性食管炎，會引起食管的潰瘍，引起上消化道出血。食管癌也會引起上消化道的出血，主要是因為癌症引起食管的壞死、潰爛而引起出血。
對於胃和十二指腸引起的上消化道出血，可能是因為出現消化性潰瘍，而引起周圍的黏膜被潰瘍侵襲，引發出血，還有可能是炎症、胃黏膜損傷引起上消化道出血，胃癌也可能引起上消化道的出血。肝臟、胰腺出現疾病時也可能引發上消化道的出血，例如患者有急性胰腺炎時，如果伴有膿腫，膿腫破潰到十二指腸，引發上消化道的出血。