小兒自體骨髓移植的優點主要是安全、無排斥反應。因為是使用自己的造血幹細胞移植所以安全度是比較高的，且不會有機體的排異反應。而缺點主要是容易復發，因為是用自己的幹細胞，這樣比較容易復發，若出現復發建議還是及時到醫院做處理比較好，以免加重。該類療法主要是用於治療白血病的，通過治療後病情是可以得到較大好轉的。