潰瘍性直腸炎一般來說自愈的可能性不大，主要是因為炎症以及侵犯到粘膜肌層引發潰瘍，通常裡急後重、腹脹、腹瀉、腹痛等症狀明顯。需要暫時局部用藥對症緩解症狀，用藥原則為解除腸道痙攣，緩解腹瀉腹痛，調理菌群失調幫助消化，促進粘膜癒合。如症狀得不到有效控制還需要選用激素、免疫抑制劑、抗生素等全身性、局部性的用藥。