兒童腎病綜合徵主要有以下幾個原因所引起來的：
第一類，稱之為原發性腎病綜合徵。目前確切的病因還不是特別明確，通常認為跟自身的免疫機制有比較大的關係，直接的誘因通常是感染，比如說細菌、病毒或者寄生蟲的感染等等，感染以後誘發了免疫的紊亂，從而能出現腎病綜合徵。
第二類，遺傳性的腎病綜合徵，常常是由於父親或者是母親的遺傳基因突變所導致的，稱之為遺傳性腎病綜合徵，也見於孩子自身的基因突變所導致的。
第三類，稱為繼發性腎病綜合徵，常常繼發於一些其他的疾病，比如說像系統性紅斑狼瘡或者是過敏性紫癜等等，都可以引起繼發性的腎病綜合徵。