腎小球腎炎在沒有合併感染的前提條件下，一般不會使用抗菌素來預防感染。初發的急性腎小球腎炎可以使用消炎藥，穩定後不在利用抗菌素做保駕。腎小球腎炎容易合併各種感染，包括肺部感染，腸道感染，泌尿道感染，皮膚感染，敗血症和帶狀皰疹等。要根據藥物敏感試驗選擇抗生素。一般選擇腎毒性有比較小消炎藥，常用的有青黴素類，第三和四代頭孢菌素類，以及大環內酯類。