慢性腎盂腎炎主要是抗感染，可服用抗生素防止感染，祛除誘因。常用的抗生素類藥物有青黴素，若患者對青黴素過敏，可用紅黴素代替。由於慢性腎盂腎炎的病菌較複雜，可通過尿細菌培養確定細菌的類型，若有發熱等症狀應臥床休息，直到病情穩定方可下床。慢性腎盂腎炎易復發，飲食上不要吃海鮮，牛肉，羊肉，辣椒等發物，還要減少食鹽的攝入。