小孩子反覆高燒39℃以上，最常見的可能是感染性的因素造成的，比較常見的可以是病毒感染，也可以是細菌感染。流感病毒或者是一些腺病毒、呼吸道合胞病毒感染，都可能引發出現高熱情況，這種皰疹病毒也會引起高熱反應。這個時候首先要知道病毒感染的類型，相應的進行適當的處理。
還有些高熱可能與細菌感染有關，像比較常見的扁桃體化膿或者扁桃體發炎，這種一般是溶血性鏈球菌感染為主進行的感染，需要進行抗炎治療才能緩解。當然還有些反覆高熱可能與像川崎病或者EB病毒感染，都能造成出現反覆發熱。當然也有些風溼、類風溼或者血液疾病，也會出現反覆發熱39℃以上的情況。所以引起發熱的病因很複雜，可以是感染因素，也可以是非感染因素，需要結合臨床症狀及相關檢查才能判斷。