感染天花病毒還沒有確定有效的治療辦法。患者主要是需要嚴格的隔離直至痊癒，隔離時間不得少於40天。其衣物，用具，呼吸道分泌物，皰疹滲出物需要嚴格消毒，與患者接觸的人員應該立即種痘。患者通常是以支持療法進行治療，給以充足的水分及營養，比如靜脈注射電解質，營養品或以藥物控制高熱和疼痛。同時對年幼體弱者以抗生素預防感染天花病毒後隨之而來的細菌感染。