小兒埃博拉病毒病的臨床表現為發熱、寒戰、疲乏無力、皮疹、關節及神經系統疼痛和出血等，部分患者嚴重出現食慾減退、腹痛及腹瀉等症狀，嚴重者可併發瀰漫性血管內凝血和中風。
一、典型症狀
1、發熱、寒戰：因感染導致血象升高，機體防禦系統起作用，從而產生高熱；患者病情初期高燒不退、全身發冷等症狀。
2、疲乏無力：因高熱導致機體防禦系統出現紊亂，可出現精神萎靡不振、渾身無力等症狀。
3、皮疹：發病初期，肩部、手心和腳掌等多個部位出現斑丘樣皮疹，一般為暗紅色。
4、關節及神經系統疼痛：病情初期患者身體多個部位頭痛，如頭痛、咽痛、關節痛及肌肉痠痛等，神經系統出現異常，表現為嗜睡、意識不清及精神恍惚等。
5、出血：病情加重後可出現不同程度的出血，包括鼻、口腔出血，眼結膜出血、大便帶血及陰道出血等，還有人出現吐血和尿血等症狀。
二、其他症狀
本病部分患者嚴重出現食慾減退、腹痛及腹瀉等症狀。