口臭的原因有很多，包括鼻腔的疾病、口腔的疾病以及胃食管反流病，鼻腔的疾病主要是瀰漫性的鼻炎造成的鼻腔阻塞以及鼻竇炎等，都是因為引流不暢再合併細菌感染，形成的化膿性的炎症引發的口臭。
口腔的疾病主要是因為口腔黏膜乾燥，如干燥綜合徵以及齲齒，還有口腔的潰瘍、牙齦炎等都可以引起口臭，分別就診耳鼻喉科和口腔科，行相關檢查，明確病因後進一步的治療。消化科的疾病主要是胃食管反流病可以引起口臭，是因為胃十二指腸內容物反流到食管中，再進一步反流到口腔中而引發，往往是食道下段括約肌結構和功能障礙所引起，比方食道裂孔疝。