頸淋巴結結核作為肺外結核病變，在治療時與一般的結核治療原則相同，堅持早期聯合、適量和全程用藥。抗結核用藥至少半年，有時長達一年半之久。有多個大的、乾酪樣變的淋巴結核久治不愈者可以手術切除。
一、藥物治療
本病治療常用藥物有異煙肼、利福平、吡嗪酰胺、鏈黴素，強化階段通常採取四聯藥物治療2個月，即異煙肼、利福平、吡嗪酰胺和乙胺丁醇。採用這種方案的目的在於儘量降低繼發性耐藥的產生。繼續治療階段通常採取二聯藥物(異煙肼和利福平)治療至少4個月，因此頸部淋巴結結核的總療程為6個月。對於強化治療期間聯合服用吡嗪酰胺的患者，繼續治療階段應延長至7個月，總療程為9個月。
二、手術治療
當淋巴包膜完整尚未破潰形成膿腫時，此時周圍組織清楚、解剖標誌清晰，是最好的手術時機。如果體格檢查腫塊單一、侷限，與周圍組織無明顯粘連可採取局麻切除腫塊，術後一經確診即行抗結核治療。
三、其他治療
1、寒性膿腫未穿破者，可向腔內注入5％異煙肼液沖洗，並留適量於膿腔內。
2、慢性潰瘍或竇道如無明顯感染，可行刮除術，傷口開放引流，不予縫合。