十二指腸相交通的器官不同，內瘻給機體帶來的後果不同，由此產生的症狀常因被損害的器官的不同而差異較大，十二指腸外瘻的的症狀是腸液外漏引起的發熱、呃逆。部分患者可引起出血、感染、營養不良等併發症。
1、十二指腸內瘻：與十二指腸相交通的器官不同，內瘻的症狀不同。
（1）十二指腸膽囊瘻：症狀頗似膽囊炎，如噯氣、噁心、嘔吐、厭食油類、消化不良，有時有寒戰、高熱、腹痛，出現黃疸而酷似膽管炎、膽石症的表現。
（2）十二指腸膽總管瘻：通常只出現潰瘍病的症狀，有少數可發生急性化膿性膽管炎。
（3）十二指腸結腸瘻：良性十二指腸結腸瘻常有上腹部疼痛、體重減輕、乏力、胃納增大，大便含有未消化的食物或嚴重的水瀉，有的病人可有嘔吐，可聞到嘔吐物中的糞臭。
2、十二指腸外瘻：
（1）發熱：一般體溫在38℃～39℃之間，引流通暢者，發熱程度輕些，發熱與流出腸液一樣，是一個重要的症狀。
（2）呃逆：常因漏出的腸液向膈肌方向流注，刺激膈肌而產生呃逆。注意觀察有無呃逆的症狀，對於早期診斷很有幫助。尤其對未放置腹腔引流者，呃逆是一個重要的信號。
（3）腸液流出與腹肌緊張：局部腸液流出的多少主要取決於十二指腸外瘻的類型、位置、大小及十二指腸內的壓力。由於放置了腹腔引流，局部腹肌緊張可不顯著；引流不通暢或未放置腹腔引流者，肌緊張較明顯。