對於比較中重度的細菌性感染引起的腸繫膜淋巴結炎，可使用抗生素治療。如果孩子出現發熱、腹痛可以給孩子按時的吃退燒藥，退燒藥可以選擇布洛芬或對乙酰氨基酚。另外如果孩子明顯的出現腹痛的情況可以吃止痛的藥物，這些藥物的治療都是在醫生的指導下進行，家長不要盲目的應用藥物。
小兒急性腸繫膜淋巴結炎屬於自限性疾病，如果是單純的腹腔淋巴結腫大，孩子本身沒有什麼特殊的症狀，一般無須使用抗生素。但如果是中重度的感染導致的腸繫膜淋巴結腫大，根據具體情況可以在醫生的指導下選用有效的抗生素治療。一般的治療以保守治療為主要方式，如果出現明顯的嘔吐要禁食，出現明顯的細菌感染或者病毒感染要應用抗生素治療和抗病毒治療。