胃腸炎最常見的症狀就是腹痛，腹脹，腹瀉，噁心，嘔吐等等。其中腹痛最為多見，性質大多數為急性銳痛，可以間斷髮作，多見於劍突下或臍周。嘔吐物為胃內容物甚至是膽汁，可以伴有或者不伴有發熱的表現。腹瀉多數為稀便、糊狀便，甚至是水樣便等等。有一少部分患者會伴有反酸、燒心的不適感。少數患者會由於細菌入血引起寒戰表現。