形成膽結石的病因多種多樣，通常是多種病因共同作用下所產生的結果，並不是單一因素一定會產生膽結石，比如高脂肪、高膽固醇飲食，以及某些藥物、膽道感染、膽汁淤積、某些寄生蟲感染、膽道蛔蟲、糖尿病、高血脂、肥胖等，都有可能會導致膽結石。
膽囊裡面有膽汁酸和膽固醇，當膽固醇的濃度過高時就容易析出結晶，形成膽固醇性結石。而當某些膽紅素、膽色素異常析出，有可能會形成膽色素性結石。所以，膽結石形成的因素很多，包括一些常見的誘因，如暴飲暴食、進食油膩食物，也容易誘發膽結石的發作。此外，膽結石發作也與抵抗力下降、勞累或精神緊張相關。