慢性結腸炎是一種民間稱呼，在書本上並沒有相應的定義及診斷標準。民間把各種原因導致慢性腹瀉，部分患者伴有黏液膿血便，這樣一群患者稱之為慢性腸炎的患者。慢性腸炎包含的疾病很多，慢性腹瀉的成因可以分為四大類型：一、動力性腹瀉；二、分泌性腹瀉；三、滲出性腹瀉；四、滲透性腹瀉。
這四種腹瀉類型是依據發病機制來進行分類的，其中與細菌感染有直接或間接關係的，有滲出性腹瀉，以及分泌性腹瀉。如果發現有細菌感染導致的腹瀉，可以使用針對性的抗生素進行治療，這一部分腹瀉病因明確，所以可以根治。但是很多病因下不明確的腹瀉，也就是病因不明確的，所謂慢性腸炎的患者，是不可能得到根治的，僅僅通過藥物可以達到對症治療。