肝區疼痛是原發性肝癌最常見的臨床症狀，也是很多患者的首發症狀。肝區疼痛大多表現為持續性的鈍痛、刺痛或者脹痛，這主要是由於腫瘤刺激肝包膜所引起的。肝臟特殊部位的肝癌還有可能造成比較有特徵性的疼痛症狀，比如說右葉頂部的腫瘤。如果侵犯膈肌，有可能引起右肩背部疼痛。而當肝癌出現破裂出血時，首先會出現右上腹劇烈疼痛，隨後疼痛可以彌散至全腹，伴有腹膜刺激徵。隨著原發性肝癌病情的進一步進展，肝區的疼痛也會逐漸加重，嚴重的甚至會影響患者的飲食和睡眠。