鹼性磷酸酶增高的原因在臨床上是非常多的，最常見的還是肝膽系統的疾病，比如說膽管結石，膽管癌，胰頭癌，壺腹周圍癌，原發性硬化性膽管炎，肝癌，病毒性肝炎等，當然酒精肝，脂肪肝，膽囊炎，膽管炎也可以引起。此外，其他系統的疾病比如說佝僂病，骨的惡性腫瘤，惡性腫瘤骨轉移以及甲狀旁腺功能亢進症等也可以引起，具體還需要通過伴隨的症狀和影像學檢查來明確。