女性乳房發育不良大部分和青春期內分泌障礙有關，例如雌性激素分泌不足，導致乳腺腺葉和腺泡發育不良。或者發育期營養不良導致乳房發育遲緩。有些乳房基本無發育跡象，可能和遺傳因素有關。而青春期的內分泌紊亂引起的發育不良，可能是性腺發育不良，或先天性卵巢發育不良引起。這部分患者女性特徵不明顯，而且月經也會有異常，或者出現閉經的情況。