消化性潰瘍多發生在十二指腸和胃，十二指腸潰瘍發病最重要的原因是胃酸分泌過多。過多的胃酸不斷刺激，腐蝕著胃黏膜，使十二指腸黏膜發生潰瘍。胃潰瘍的主要發病原因是幽門螺桿菌感染和胃黏膜保護作用減弱引起的。由於幽門螺桿菌感染，使胃黏膜保護作用減弱，所以胃內的消化液，就會侵蝕胃黏膜，出現黏膜的潰瘍。胃排空延緩，膽汁反流，經常吃非甾體類抗炎藥等，也是消化性潰瘍發病的原因。