腦膿腫會鈣化，一般來說膿腫急性期不可能鈣化，在膿腫清除、吸收、侷限以後，組織會產生反應，包括機化殘留的膿腫或者炎性組織，在這個過程當中，部分會慢慢鈣化。
所以在腦膿腫急性期，需要積極治療，清除膿腫，沖洗乾淨，選用合適的抗生素控制感染，儘可能減少膿腫殘留和控制感染，這樣在局部產生的慢性反應會比較少，不容易機化和鈣化。