舌咽神經痛是在舌咽神經分佈區域內的驟然發生的劇烈疼痛，多見於男性。一般疼痛的部位主要是在咽後壁、舌根、軟顎、扁桃體、咽部，及外耳道等處，可以自發出現疼痛，也可以由觸碰扳機點而引發疼痛，也可以由吞嚥、講話等運動而引起疼痛。它和三叉神經痛的區別是睡眠的時候也可引起疼痛發作，一般疼痛持續數秒、數十秒到數分鐘，兩次發作間期沒有任何的疼痛症狀。每次的疼痛可以呈電擊樣、刀割樣、撕裂樣、燒灼樣，各種各樣的疼痛，可以在咽部噴射地卡因，如果疼痛停止就可以確診。治療沒有太好的方法，可以口服藥物，常用的藥物有卡馬西平、苯妥英鈉等等，服用藥物以後就可以控制疼痛，緩解症狀。