對於顱內感染的治療首先必須引流感染的腦脊液，因為腦脊液每年產生約400--500ml，一般通過腰穿引流或腦室外引流將感染的腦脊液置換出來。如果一旦發生顱內感染，需要連續3次進行腦脊液培養，塗片，生化和常規檢查。引流腦脊液的同時根據培養結果選擇敏感性抗生素。顱內感染的治療療程一般為4--6周，同時需要在症狀完全控制後在治療1周。