尿路結石在男性和女性當中的臨床表現並無區別，尿路結石的主要臨床表現為當結石位於腎盂腔內時，多數無臨床症狀或僅伴有輕微的鈍痛、隱痛症狀。當結石向外溢出進入輸尿管內形成輸尿管結石，患者可出現突然發作的脊肋角和腰部的刀割樣疼痛，常伴有放射痛，受累部位為同側的下腹部腹股溝股內側，男性可放射至睪丸和陰莖口，女性可放射至陰唇。
血尿是腎結石的另外一個常見臨床症狀常常在腰痛後發生，血尿產生的原因是結石移動或者患者劇烈運動，導致結石對集合系統的損傷。當輸尿管結石發作時，輸尿管腔內壓升高，由於輸尿管和腸道有共同的神經支配，可引起患者的噁心、嘔吐症狀。
對於腎絞痛發作時可能伴有或者不伴有低熱，由於結石梗阻和感染可以相互促進，腎結石造成的梗阻可繼發或加重感染，出現腰痛伴高熱、寒戰等，其它症狀比如還存在無尿或者急性腎功能不全、腎積水和慢性腎功能不全的症狀。