通常對於龜頭炎的治療，可以採用殺菌的軟膏，如百多邦、匹得邦、美多信、紅黴素，以及抗真菌的藥膏，如氟康唑、酮康唑。
大多數包皮龜頭炎通常是由於細菌、真菌，以及支原體、衣原體、滴蟲等微生物感染所導致，通常好發於包莖和包皮過長的男性，有可能會出現包皮的紅腫、疼痛、瘙癢、紅點、紅斑，甚至出現潰瘍、糜爛以及膿性的分泌物。在臨床上用以上藥物進行治療，大多數可以得到比較好的效果，若反覆的感染髮炎、包皮縮窄，也可以考慮行包皮環切術。