硝酸咪康唑乳膏可以用於龜頭炎的治療，主要是應用於白色念珠菌性包皮龜頭炎的治療。在感染性包皮龜頭炎的發病當中，其致病的病原微生物不同，所導致的包皮龜頭炎臨床表現也不盡相同，通常仍夠引起包皮龜頭炎常見的致病微生物，包括白色念珠菌、滴蟲、支原體、衣原體和各種細菌。無論是哪一種病原微生物所導致的包皮龜頭炎，其治療的原則一致，就是內外兼治、抗菌消炎。
治療包皮龜頭炎主要的方法是應用口服藥物和局部的外用藥物，在白色念珠菌性包皮龜頭炎的治療當中，口服的藥物主要是伊曲康唑和曲古黴素。外用的藥物包括碳酸氫鈉溶液的局部清洗，以及咪唑類的軟膏，其中硝酸咪康唑軟膏等藥物都有抗真菌的作用，所以也可以用於白色念珠菌性包皮龜頭炎的治療。