膀胱結石的治療，通常包括較小的結石，如小於0.6cm的結石，通常可以自行排出體外。
大多數的膀胱結石需要進行外科治療，包括體外衝擊波碎石來進行治療，或者採用腔內的治療手段，如經尿道器械碎石、大力碎石鉗，或者經尿道液電碎石、經尿道超聲碎石、經尿道氣壓彈道碎石，或者經尿道激光碎石術，一些較大的結石同時會合並前列腺增生。膀胱腫瘤等患者也可以考慮行膀胱切開取石，同時處理併發病變，通常需要在專業醫生指導下選擇合理的手術方案。