在大多數生理情況下卵圓孔未閉不會出現症狀，只有在劇烈咳嗽、劇烈運動、潛水時可能出現偏頭痛、頭暈、呼吸困難或肢體無力等，隨著誘因的解除，上述症狀多可自行緩解。如果持續不緩解，有發生腦卒中危險。
卵圓孔是人體胚胎時期就存在的心臟結構，嬰兒出生後應當功能性閉合，一歲內永久閉合，如果未閉合就是卵圓孔未閉。在生理狀態下，不會導致血液異常分流或分流量少，所以患者不會出現症狀，也不影響生長發育，只有當劇烈運動等原因使右心房壓力超過左心房時，卵圓孔未閉才會出現明顯的右向左血液分流，才會出現臨床症狀。