胸腺瘤的治療方法包括手術、放療和化療，其中手術是較為主要的一種治療方法。對於手術來說，無論腫瘤大小，都要求儘可能的全切。較小的腫瘤可以在腔鏡下完成。目前大的腫瘤也同樣可以採用腔鏡完成。對於合併有肌無力的患者，要求儘可能清除胸腺周圍脂肪組織。對於一般原發性腫瘤不能切除、或者無法完全切除的，可以選擇放射性治療，放射治療的同時要考慮到放療損傷的因素。化療一般選用含有鉑類的藥物，通過化療可以通提高手術的治癒率。