肛裂術後排便不痛，完全恢復可能需要兩週。肛裂手術後給予對症止痛治療，同時保持大便柔軟通暢，避免刺激會明顯緩解疼痛，隨著切口的癒合疼痛也會逐漸減輕。由於肛門周圍的神經比較豐富，所以患有肛腸疾病的患者，常常忍受著劇烈的疼痛，對於需要手術治療的患者，總是擔心手術時或手術後會不會非常疼痛。
隨著醫療水平的提高肛裂手術技術已今非昔比，肛裂的手術可以選擇局部麻醉、骶管麻醉或者腰麻，手術中操作的時候，患者沒有明顯的疼痛感覺，不然無法進行手術。疼痛大多在術後，其實肛裂手術對肛門部本身是種創傷，因為肛門部神經分佈緻密，神經肌肉相聯密切，手術破壞了皮膚組織的完整性，在手術以後麻醉作用消退後，病人恢復痛覺，尤其是在換藥的時候疼痛會加重。術後短期內可以規律給予鎮痛藥物，降低減輕疼痛程度。在圍手術期間預防創面的刺激和感染，大便後坐浴也是有效的止痛方法。多種手段進行疼痛干預，會基本上保證了患者在術中或術後疼痛明顯減輕，大幅度提升患者的生活質量。