肝移植是目前非常複雜的一種手術方式，雖然目前肝移植的成功率可以達到80%-90%，但仍有少部分患者肝移植術後出現死亡。目前認為出現肝移植死亡的主要原因包括排斥反應、膽道併發症、嚴重感染、肝癌、肝炎復發等。對於急性排斥反應的患者，有可能需要再次肝移植，否則很容易導致移植肝臟喪失功能，最終引起死亡。目前研究認為良性病變和遺傳性病變所導致的肝功能衰竭，要比惡性腫瘤所進行的肝移植存活時間要長。