甲狀腺囊腫大部分不需要特別治療，甲狀腺囊腫是甲狀腺結節的一種形式，它裡面的一種液體，是良性的改變。通過局部觸摸發現頸部甲狀腺部位有包塊，或者是感覺到頸部不舒服，可通過甲狀腺超聲幫助明確診斷。在超聲底下可以顯示甲狀腺囊腫的改變，並不是低迴聲或者是高回聲。甲狀腺囊腫絕部分都是良性的改變，不需要進行穿刺的檢查。
如果沒有明顯的壓迫症狀，也就是不是很大，沒有明顯的吞嚥困難或者是呼吸困難、聲音的嘶啞，而且通過甲狀腺功能的檢查，比如甲狀腺功能沒有增高或者降低，無需進行特殊的治療，也沒必要進行所謂的手術、藥物以及飲食的治療，僅僅需要定期複查。但如果甲狀腺的囊腫比較大，或者是有壓迫的症狀，就需要在普通外科醫生的指導下進行相應的檢查，有可能需要進行手術治療。