甲狀腺的疾病主要跟甲狀腺激素水平高低有一定關係，同時跟甲狀腺本身是否出現了團塊，以及結節是否發生了癌變有一定關係。甲狀腺激素水平發生異常，最常見的甲狀腺疾病是瀰漫性甲狀腺腫，伴甲狀腺功能亢進症以及急性甲狀腺炎、亞急性甲狀腺炎、橋本氏甲狀腺炎。
發生甲狀腺疾病時出現各自臨床症狀，發生甲亢時給予抗甲狀腺激素的藥物治療，發生甲狀腺功能減退症時給予左甲狀腺激素替代治療。發生甲狀腺癌症病變時，應該給予手術或者核素碘-131的治療，具體根據患者發生的臨床症狀、體徵、實驗室檢查綜合評判，然後再給予對症的治療。