有些類型的卵巢囊腫會影響懷孕，尤其是子宮內膜異位囊腫。子宮內膜異位囊腫是公認的會影響懷孕的不孕症原因，它會導致排卵異常、輸卵管周圍粘連、子宮內膜容性下降、卵子的質量下降，同時會對精子和胚胎造成毒害作用。如果患有子宮內膜異位症囊腫，會導致不孕症。如果在孕前發現有子宮內膜異位症囊腫，可以檢查卵巢儲備功能，再看囊腫的大小。如果囊腫比較小，可以先嚐試懷孕，如果不孕，再針對不孕症進行治療。如果囊腫比較大在5cm以上，同時卵巢儲備功能也基本正常，可以考慮先做手術再懷孕。此外像卵巢的真性腫瘤也建議在懷孕前手術，尤其是雙側腫物，裡面有實性或者囊實性成分，腫物增長比較快，還有腫瘤標記物異常的患者。