滴蟲性陰道炎不能自愈，在正常的情況下，陰道內有許多菌群存在，但是由於陰道與菌群之間形成了一個生態平衡而不致病，主要是乳桿菌和雌激素維持著陰道內的生態平衡，維持著陰道偏酸狀態而不致病。
陰道在正常的情況下，pH值是3.8-4.4，只有在陰道內環境被破壞以後才會致病。滴蟲容易在pH值為5.1-5.4之間存活，pH值＜5或者pH值＞7.5的環境中，滴蟲就不生長。只有通過藥物改變陰道內環境，滴蟲性陰道炎才能治癒。