畸胎瘤手術可能會對卵巢功能有一定影響，但絕大多數人影響比較輕微，很多人也是可逆的。對於卵巢儲備功能下降的患者，需要在手術前考慮，畸胎瘤手術不管是通過腹腔鏡還是開腹手術，在去除卵巢畸胎瘤同時，不可避免會導致周圍卵巢組織的損失。有些患者在做手術之後，有卵巢儲備功能下降，但絕大多數這種影響都是比較輕微的，很多人在術後一年左右卵巢功能還會有所恢復。對於卵巢儲備功能嚴重下降，同時合併不孕症的患者，選擇畸胎瘤手術相對比較慎重，建議可以考慮試管嬰兒，得到冷凍胚胎之後，然後再考慮做畸胎瘤手術，以免手術後卵巢功能嚴重下降，導致無法獲得卵子的可能性。