寶寶便血的原因有很多，最常見的有消化道的出血，也就是血液至肛門排出體外。原因最常見的比如腸道的感染、小傷寒、痢疾、腸道寄生蟲感染等等。還有消化道的潰瘍，比如肝硬化引起的食道靜脈曲張出血。還有應激性潰瘍、出血性壞死性小腸、結腸炎。小朋友常見的是腸套、腸梗阻、消化道的發育畸形。
腸道的息肉、痔瘡、肛裂；血液系統，比如血小板減少性紫癜、再障、白血病等等。還可以常見於有些寶寶是乳糖不耐受，寶寶的大便裡可以出血，一些過敏也會引起。只要寶寶大便如果有血，不管是哪種原因，儘量把寶寶大便、寶寶帶上，一同到醫院進一步檢查，明確診斷，早日給予治療。