可以通過做胎兒三維彩超，或者是胎兒四維彩超、磁共振檢查來初步排除胎兒眼睛畸形。
如果彩超和磁共振看兩側眼眶都正常，一般說明胎兒眼睛發育正常，無法再進行下一步的檢查。因為胎兒的眼睛不在常規排查畸形的範疇之內，常規做排查畸形，需要在24周左右做胎兒三維彩超，或者是胎兒四維彩超，要求排查出國家規定的常見的畸形，包括腦積水、脊柱裂、四肢缺如，或者嚴重的先天性心臟病等等，但是有些小的畸形無法看到，包括胎記、手指和腳趾的數量，或者眼睛、耳廓等等，這些只能生後再進行相關的檢查。另外磁共振也可以相對準確的觀察胎兒是否有畸形，也可以考慮做磁共振。