藥物流產和無痛的人工流產各有利弊，不能簡單的評價哪個對身體的損傷更小，哪個損傷大。藥物流產通常用米非司酮加米索前列醇口服來序貫治療，終止宮內妊娠孕齡大於49天的。它的優點是藉助於藥物的方式來終止和排出妊娠組織，它主要是模擬自然流產的過程，對於生殖道的損傷相對比較小，但存在藥物流不全需要清宮或者導致大出血的現象。
人工流產的時間比較短，一般3-5分鐘就可以完成，而且在無痛下不會感覺到疼痛。另外不全流產宮內殘留的機會比較小，但它是一個手術操作，會導致宮頸和子宮內膜損傷。人工流產的適應症是宮內妊娠小於70天的，最佳的時機是宮內妊娠6-8周。藥物流產和無痛人流手術各有優缺點，主要看個體的情況，先要明確適應症，如果能完全避免不全流產、藥物流產失敗後宮腔殘留的情況，藥物流產要比人工流產損害的稍微輕一些，但是藥物流產存在流產失敗、殘留、出血，需要再次清宮的風險。人工流產往往上述的情況比較少，但可能會對子宮內膜有一定的損害。