房撲和房顫相比來說房顫的危害更大一些，房顫對於人有兩個危害：
第一、房顫的反覆發生，尤其是長時間的持續會影響心功能，會使心功能下降，出現心搏量下降、心衰的症狀。
第二、血栓栓塞的風險增加，房顫發生的時候心房已經失去有效的收縮和舒張的功能，心房在顫動，血液在左心耳部位容易發生遄，形成血栓，血栓脫落之後會引起全身動脈系統的栓塞，尤其是腦栓塞的風險會明顯的增加。另外，房撲發作的時候雖然撲動波的頻率也是很快的，但是大部分會有一定的比例傳導到心室，所以相對對心功能的影響會少一點。再一個房顫比房撲更容易發作，在臨床上更常見。
第三、在治療方面，房撲的治療效果，尤其射頻消融的效果相對要好一些，大部分經過一次治療之後成功概率會比房顫要高。