排卵障礙的主要症狀會表現為月經週期的推後，甚至還可能導致閉經。由於長時間不排卵，還可能引起無排卵型的功血，這時就可能出現陰道大量出血，出血時間會明顯延長，甚至還會出現頭暈、乏力、心慌等貧血表現。少部分女性還可能出現陰道出血淋漓不盡，出血顏色是咖啡色或黑色。
1、無排卵性功血：該症狀青春期女性最多見，出血間隔時間可長可短，可從幾天到數月，甚至1年以上。出血持續時間亦可長可短，常在生活中某些事件如考試、比賽、劇烈運動等後發生。出血量少時僅點滴出血，多時可有大血塊，出現嚴重貧血。長期出血時因盆腔充血而下腹墜脹，乳房受雌激素影響而脹痛，亦可出現面部與四肢水腫。
2、月經不調甚至閉經：排卵障礙也會影響正常月經，排卵障礙較為直接症狀是會發生月經失調和閉經。
3、第二性徵出現異常：身材高大和第二性徵發育不良也是不排卵其中的一個症狀，主要是因為中樞神經異常，繼而引發性功能不正常，導致全身毛髮增多，腎上腺分泌雄激素出現增多。
4、不孕：排卵障礙可能會導致女性不孕，不孕是指正常性生活並未採取避孕措施12個月後未妊娠，排卵障礙或稀發排卵約佔女性不孕因素的40%。
5、卵巢功能低下：低雌激素引起的相應症狀，如患者為40歲以上，無生育要求，可以不做特殊處理和治療。