根據不同病因引起的排卵障礙、病情程度及生育要求，採用個體化處理措施。主要採用藥物治療，對於有其他基礎病導致身體激素水平紊亂的患者，需先治療基礎疾病，再誘導排卵。
一、藥物治療
1、枸櫞酸氯米芬片：枸櫞酸氯米芬片是臨床首選的促排卵藥物，適用於體內有一定雌激素水平和下丘腦-垂體反饋機制健全的患者。但需注意用藥週期行陰道B超監測卵泡生長，卵泡成熟後用絨促性素肌內注射。
2、來曲唑：來曲唑用於枸櫞酸氯米芬抵抗患者，用藥週期行陰道B超監測卵泡生長，卵泡成熟後用絨促性素肌內注射，排卵後進行黃體支持。由於缺乏胎兒遠期安全性資料，應用仍需謹慎。
3、促性腺激素：適用於低促性腺性性腺功能減退、輔助生殖生育技術、應用枸櫞酸氯米芬治療無排卵或有排卵但未妊娠者，可單獨應用或與枸櫞酸氯米芬聯合應用。
（1）人類絕經期促性腺激素：推薦人類絕經期促性腺激素作為下丘腦-垂體中樞排卵障礙的首選用藥，建議在誘導排卵前給予雌、孕激素序貫治療預處理。
（2）卵泡刺激素：可作為二線促排卵方案用藥，應用於氯米芬抵抗患者，卵泡刺激素誘導排卵治療不建議超過6個排卵週期。
4、溴隱亭片：適用於高泌乳素血癥的無排卵患者，血催乳素下降至正常水平，且用藥期間每3~6個月複查血催乳素水平，建議一旦妊娠，停止使用，對妊娠婦女在撤藥期應嚴密監控。
5、卡麥角林和諾果寧(又名喹高利特)：適用於溴隱亭抵抗或不耐受溴隱亭治療的泌乳素腺瘤患者。
6、二甲雙胍：二甲雙胍為胰島素增敏劑，適用於胰島素抵抗患者，可做為無排卵患者的一線用藥，肝腎疾病禁忌。
二、手術治療
排卵障礙一般無需手術治療。