男性不育最主要檢查項目是查體還有精液常規檢查，查體主要是檢查第二性徵，外生殖器發育情況，有無隱睪、包莖、尿道下裂等，精液常規需要同房後3-7天，查精液常規主要查精子的數目、濃度、精子活動度，還有畸形精子比例，如果一次檢查異常可以再複查一次。對於精子質量很差的患者，需要查血內分泌六項，還有染色體核型檢查，還有Y染色體微缺失檢查，部分患者需要做超聲檢查睪丸、附睪和精索靜脈，但主要檢查還是查體和精液常規檢查。