不同原因引起的新生兒肺炎，治療的結果也會有很大的差異。羊水吸入和血液吸入的肺炎相對來說預後比較好，一般7-10天左右可能就會好轉。胎糞吸入性肺炎的治療時間取決於胎糞吸入的質和量，重症胎糞吸入性肺炎的病死率，可達到2%-7%左右，所以治療時間會相對較長。感染性肺炎一般與感染的病原以及自身的抵抗力有關，如果是常見的病菌，可能在14天左右緩解。也有些孩子可能會感染，出現其他併發症，病程容易出現遷延。容易併發先天性的疾病，合併膿氣胸、心力衰竭和呼吸衰竭等，可能也會預後較差。