心肌炎患者，首先應當進行抗感染治療，包括抗細菌、真菌、病毒等。對於病情較為嚴重的患者，可以明確病原菌，針對病原菌，選擇敏感的藥物治療。心肌炎的患者，容易出現心律失常和心力衰竭，可以使用抗心力衰竭的利尿劑，呋塞米、強心劑地高辛。抗心律失常藥物氨碘酮等，具體藥物的用量以及用法，應當根據病情而定。同時還可以使用營養心肌的藥物，比如輔酶Q10、三磷酸腺苷等。