臨床診斷敗血症，在使用抗生素以前就收集各種標本，比如血培養、痰培養、腦脊液培養等；其中血培養是最重要的。根據血培養的結果，來明確病原菌，病原菌種類決定敗血症的治療週期。如果血培養(-)，經驗性抗生素治療病情好轉後應該繼續治療5-7天；血培養(+)，療程至少需要14天：有併發症的，應該治療21天以上。血培養細菌為GBS及革蘭氏(-)菌，感染容易擴散至顱內引起腦膜炎，腦膜炎療程則達14-21天。