皰疹性咽峽炎是由柯薩奇病毒感染引起的一種呼吸道傳染性疾病。因此治療上主要是針對病毒進行治療。可以口服蒲地藍或者藍芩口服液，用藥時間五到七天。如果皰疹引起口腔潰瘍比較疼痛，可以用碘甘油塗抹。也可以用蒙脫石散和魚肝油混合調勻，塗抹在潰瘍處，可以對創面起到保護作用。此外，用開喉劍噴霧劑噴喉嚨，一天三次，抗病毒和止痛效果也很不錯。