新生兒先天性心臟病血氧飽和度數值是存在差異的，和先天性心臟病的嚴重程度有關，如果只是非常輕微的新生兒先天性心臟病，有可能不會影響到血氧飽和度，血氧飽和度數值就有可能和正常人是一樣的，會大於94%。而如果新生兒先天性心臟病較為嚴重，影響心臟功能，會出現供氧不足，則血氧飽和度就會降低，越嚴重血氧飽和度就越低，有可能只有70%~90%甚至更低。