小兒心肌炎大多數情況預後是比較好的，臥床休息可以預防急性期心肌內病毒複製的增加，明顯的改善預後。高濃度的維生素c對糾正休克和心肌的病變有很大作用的，也可以使用磷酸肌酸鈉營養心肌細胞。對於一些重症的，可以使用腎上腺皮質激素和免疫抑制劑。合併有心律失常的，需要應用抗心律失常的藥物。合併心力衰竭和心源性休克相對來說是比較嚴重的，需要積極的給予治療。