小兒大腦發育不良可以服用B族維生素、三磷酸腺苷等藥物來進行治療，服用方法需要在醫生指導下使用，這些藥物對於改善腦功能和代謝是有一定幫助的。但如果服用藥物後病情沒有得到改善，建議還是到醫院做治療比較好，以免長期下去對孩子的智力及發育等方面造成影響。該疾病在治療方面主要是對症治療，若存在有癲癇，則服用抗癲癇的藥物做治療等。